基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_006094 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:1638876-1642575 (-) |
| 描述 | Similar to truB: tRNA pseudouridine synthase B (Flavobacterium johnsoniae (strain ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101) OX%3D376686) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_006094 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0031119 | tRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.887; 覆盖度=43.258; E 值=8.25e-60; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990481 | mRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.887; 覆盖度=43.258; E 值=8.25e-60; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.887; 覆盖度=43.258; E 值=8.25e-60; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0160148 | tRNA pseudouridine(55) synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.887; 覆盖度=43.258; E 值=8.25e-60; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | aau:AAur_1565 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.161; 覆盖度=40.637; E 值=1.89e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | art:Arth_1424 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.291; 覆盖度=42.509; E 值=2.84e-56 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cpe:CPE1683 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.076; 覆盖度=39.513; E 值=8.76e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | fjo:Fjoh_0570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.887; 覆盖度=43.258; E 值=8.25e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | tfu:Tfu_0781 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.667; 覆盖度=42.697; E 值=6e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |