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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_005940
当前查询版本OH1004
位置Chr01:175998937-175999564 (-)
描述Similar to AGDP1: Protein AGENET DOMAIN (AGD)-CONTAINING P1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_005940 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g09320 异染色质结合蛋白,优先结合长转座子并特异识别组蛋白H3的'赖氨酸-9'甲基化(H3K9me)标记,对二甲基化H3K9(H3K9me2)有更强亲和力。
At1g26540 可能通过RNA运输参与植物细胞的极向生长。
At2g47230 可能通过RNA运输参与植物细胞的极向生长。 暂无已核实直接文献
At1g11420 可能通过RNA运输参与植物细胞的极向生长。 暂无已核实直接文献
At3g62300 可能在开花发育过程中作为DNA复制、转录与染色质重塑之间的连接。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006346DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000325plant-type vacuole细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.957; 覆盖度=85.185; E 值=4.02e-18; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000775chromosome, centromeric region细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000792heterochromatin细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042393histone binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042803protein homodimerization activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.957; 覆盖度=85.185; E 值=4.02e-18; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0140566histone reader activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G09320KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G26540KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.957; 覆盖度=85.185; E 值=4.02e-18UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release