基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005832 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:174279057-174286647 (+) |
| 描述 | Similar to RPS7: 40S ribosomal protein S7 (Hordeum vulgare OX%3D4513) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005832 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g02560 |
小核糖体亚基蛋白eS7y。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0346300 |
小核糖体亚基蛋白eS7。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006364 | rRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.873; 覆盖度=43.767; E 值=2.59e-27; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.873; 覆盖度=43.767; E 值=2.59e-27; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042274 | ribosomal small subunit biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.873; 覆盖度=43.767; E 值=2.59e-27; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.139; 覆盖度=43.767; E 值=2.43e-26; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.139; 覆盖度=43.767; E 值=2.43e-26; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022626 | cytosolic ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.139; 覆盖度=43.767; E 值=2.43e-26; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022627 | cytosolic small ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.873; 覆盖度=43.767; E 值=2.59e-27; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030686 | 90S preribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.873; 覆盖度=43.767; E 值=2.59e-27; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032040 | small-subunit processome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.873; 覆盖度=43.767; E 值=2.59e-27; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.139; 覆盖度=43.767; E 值=2.43e-26; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.873; 覆盖度=43.767; E 值=2.59e-27; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G02560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.139; 覆盖度=43.767; E 值=2.43e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0346300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.415; 覆盖度=45.429; E 值=5.87e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |