基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005648 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:169994310-169997571 (-) |
| 描述 | Similar to IAA26: Auxin-responsive protein IAA26 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005648 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g16500 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g51950 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0228900 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0186900 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0523300 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.534; 覆盖度=102.765; E 值=1.21e-56; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.325; 覆盖度=72.35; E 值=8.39e-49; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.534; 覆盖度=102.765; E 值=1.21e-56; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.534; 覆盖度=102.765; E 值=1.21e-56; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.534; 覆盖度=102.765; E 值=1.21e-56; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.534; 覆盖度=102.765; E 值=1.21e-56; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.534; 覆盖度=102.765; E 值=1.21e-56; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G51950 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.511; 覆盖度=101.843; E 值=3.71e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G16500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.534; 覆盖度=102.765; E 值=1.21e-56 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0228900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.325; 覆盖度=72.35; E 值=8.39e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0523300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.205; 覆盖度=71.889; E 值=3.18e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |