基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005174 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:157137359-157140128 (+) |
| 描述 | Similar to Os03g0328900: Zinc finger CCCH domain-containing protein 22 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005174 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g51950 |
体外具有 RNA 结合和核糖核酸酶活性。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g12440 |
含锌指 CCCH 结构域的蛋白 55。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0328900 |
含锌指CCCH结构域的蛋白22。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0682400 |
含锌指CCCH结构域的蛋白53。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0329200 |
含锌指CCCH结构域蛋白23。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.541; 覆盖度=78.366; E 值=4.77e-95; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.882; 覆盖度=102.874; E 值=1.08e-122; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.882; 覆盖度=102.874; E 值=1.08e-122; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.525; 覆盖度=101.815; E 值=3.32e-109; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004518 | nuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.525; 覆盖度=101.815; E 值=3.32e-109; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.882; 覆盖度=102.874; E 值=1.08e-122; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016787 | hydrolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.525; 覆盖度=101.815; E 值=3.32e-109; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G51950 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.525; 覆盖度=101.815; E 值=3.32e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G12440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.541; 覆盖度=78.366; E 值=4.77e-95 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0328900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.882; 覆盖度=102.874; E 值=1.08e-122 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0329200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.512; 覆盖度=74.433; E 值=1.65e-92 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0682400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.012; 覆盖度=102.269; E 值=3.44e-122 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |