基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004935 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:150558812-150561216 (+) |
| 描述 | Similar to PP2C38: Probable protein phosphatase 2C 38 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004935 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g12620 |
可能去磷酸化并抑制质膜 H⁺-ATP 酶(PM H⁺-ATP 酶,例如 AHA1 和 AHA2),从而对植物生长和适应性产生负面影响(通过相似性)。 | |
At3g55050 |
可能去磷酸化并抑制质膜H⁺-ATP酶(PM H⁺-ATP酶,例如AHA1和AHA2),从而对植物生长和适应性产生负面影响。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g38520 |
对质膜H⁺-ATP酶(PM H⁺-ATP酶,例如AHA1和AHA2)去磷酸化并抑制,从而负向影响植物生长和适应性。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g51370 |
可能去磷酸化并抑制质膜H⁺-ATP酶(PM H⁺-ATP酶,例如AHA1和AHA2),从而对植物生长和适应性产生负面影响。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0717800 |
可能是蛋白磷酸酶2C 60。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:1900425 | negative regulation of defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.634; 覆盖度=96.954; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902531 | regulation of intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.634; 覆盖度=96.954; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.634; 覆盖度=96.954; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.075; 覆盖度=87.817; E 值=6.46e-178; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.46; 覆盖度=95.939; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.634; 覆盖度=96.954; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.634; 覆盖度=96.954; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G12620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.634; 覆盖度=96.954; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G51370 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.075; 覆盖度=87.817; E 值=6.46e-178 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G55050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.426; 覆盖度=95.431; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G38520 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=64.752; 覆盖度=97.208; E 值=1.1e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0717800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.46; 覆盖度=95.939; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |