基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004699 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:143866367-143867824 (-) |
| 描述 | Similar to ROPGAP1: Rho GTPase-activating protein 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004699 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g22400 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g11490 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | |
At2g46710 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g08340 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g03100 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.913; 覆盖度=72.843; E 值=5.13e-150; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009664 | plant-type cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.29; 覆盖度=70.051; E 值=2.22e-135; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034059 | response to anoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.29; 覆盖度=70.051; E 值=2.22e-135; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=67.005; E 值=3.17e-134; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=67.005; E 值=3.17e-134; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.913; 覆盖度=72.843; E 值=5.13e-150; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009531 | secondary cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=67.005; E 值=3.17e-134; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005096 | GTPase activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.913; 覆盖度=72.843; E 值=5.13e-150; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G08340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=75.652; 覆盖度=58.376; E 值=1.91e-130 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G46710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=67.005; E 值=3.17e-134 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G11490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.29; 覆盖度=70.051; E 值=2.22e-135 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G03100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.058; 覆盖度=69.543; E 值=9.58e-127 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G22400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.913; 覆盖度=72.843; E 值=5.13e-150 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |