基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004643 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:142277035-142277673 (+) |
| 描述 | Similar to DREB1F: Dehydration-responsive element-binding protein 1F (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004643 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g51990 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | |
At4g25470 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | |
At4g25490 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0968800 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2WZI4 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.575; 覆盖度=82.075; E 值=3.93e-53; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.55; 覆盖度=90.094; E 值=8.34e-49; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009414 | response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.644; 覆盖度=90.094; E 值=2.48e-47; UniProt GO evidence=IEP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009631 | cold acclimation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.55; 覆盖度=90.094; E 值=8.34e-49; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009738 | abscisic acid-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.148; 覆盖度=101.887; E 值=6.11e-53; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019760 | glucosinolate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.148; 覆盖度=101.887; E 值=6.11e-53; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.644; 覆盖度=90.094; E 值=2.48e-47; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.575; 覆盖度=82.075; E 值=3.93e-53; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.148; 覆盖度=101.887; E 值=6.11e-53; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.575; 覆盖度=82.075; E 值=3.93e-53; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.575; 覆盖度=82.075; E 值=3.93e-53; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G25470 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.55; 覆盖度=90.094; E 值=8.34e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G25490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.644; 覆盖度=90.094; E 值=2.48e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G51990 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.148; 覆盖度=101.887; E 值=6.11e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0968800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.575; 覆盖度=82.075; E 值=3.93e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |