基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004493 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:138295874-138298168 (+) |
| 描述 | Similar to DRB2: Double-stranded RNA-binding protein 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004493 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0480500 |
结合双链RNA。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0150400 |
结合双链RNA。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0035196 | miRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.506; 覆盖度=113.913; E 值=3.62e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.55; 覆盖度=54.783; E 值=9.19e-78; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.506; 覆盖度=113.913; E 值=3.62e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.55; 覆盖度=54.783; E 值=9.19e-78; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003725 | double-stranded RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.506; 覆盖度=113.913; E 值=3.62e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G28380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.506; 覆盖度=113.913; E 值=3.62e-138 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G26932 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.55; 覆盖度=54.783; E 值=9.19e-78 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G41070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.429; 覆盖度=97.391; E 值=6.06e-83 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0150400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.718; 覆盖度=56.522; E 值=3.61e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0480500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.61; 覆盖度=104.058; E 值=3.85e-117 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |