基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004039 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:122847897-122848857 (+) |
| 描述 | Similar to At3g48880: F-box/LRR-repeat protein At3g48880 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_004039 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g48880 |
F-box/LRR重复蛋白 At3g48880。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g05500 |
推定 F-box/LRR 重复蛋白 23。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g08980 |
SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分，可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g30640 |
推定的F-box/LRR重复蛋白19。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g05460 |
SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分，可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010608 | post-transcriptional regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010629 | negative regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031146 | SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050829 | defense response to Gram-negative bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.738; 覆盖度=89.377; E 值=1.33e-26; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.985; 覆盖度=99.267; E 值=4.32e-10; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019005 | SCF ubiquitin ligase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1905761 | SCF ubiquitin ligase complex binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.738; 覆盖度=89.377; E 值=1.33e-26; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G48880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.738; 覆盖度=89.377; E 值=1.33e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G05460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.016; 覆盖度=90.11; E 值=3.9e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G08980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.427; 覆盖度=95.971; E 值=7.51e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G30640 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.985; 覆盖度=99.267; E 值=4.32e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |