基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_003608 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:88627466-88629273 (+) |
| 描述 | Similar to GRF4: Growth-regulating factor 4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_003608 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g52910 |
转录激活剂,在调节叶和子叶组织中的细胞扩张中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g36400 |
转录激活剂,在调节叶和子叶组织中的细胞扩张中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g37740 |
转录激活剂,在调节叶和子叶组织中的细胞扩张中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0204800 |
转录激活因子,在赤霉素诱导的茎伸长中起调控作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0678800 |
转录激活因子,在赤霉素诱导的茎伸长中起调控作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.95; 覆盖度=107.278; E 值=8.82e-62; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.95; 覆盖度=107.278; E 值=8.82e-62; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008285 | negative regulation of cell population proliferation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.844; 覆盖度=41.509; E 值=6.82e-46; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.844; 覆盖度=41.509; E 值=6.82e-46; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009624 | response to nematode | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.844; 覆盖度=41.509; E 值=6.82e-46; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009739 | response to gibberellin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.844; 覆盖度=41.509; E 值=6.82e-46; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032502 | developmental process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.486; 覆盖度=79.784; E 值=6.31e-37; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048364 | root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.844; 覆盖度=41.509; E 值=6.82e-46; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048366 | leaf development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.95; 覆盖度=107.278; E 值=8.82e-62; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.95; 覆盖度=107.278; E 值=8.82e-62; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.844; 覆盖度=41.509; E 值=6.82e-46; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.95; 覆盖度=107.278; E 值=8.82e-62; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G36400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.844; 覆盖度=41.509; E 值=6.82e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G52910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.95; 覆盖度=107.278; E 值=8.82e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G37740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.875; 覆盖度=99.461; E 值=6.52e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0678800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.704; 覆盖度=38.275; E 值=1.36e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:107276671 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.486; 覆盖度=79.784; E 值=6.31e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |