基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_003005 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:64639367-64641511 (-) |
| 描述 | Similar to CG1: Zinc finger CCCH domain-containing protein 16 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_003005 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g75340 |
含锌指 CCCH 结构域的蛋白 16。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0704300 |
转录激活因子，可结合双链DNA及单链RNA聚合物poly(rA)、poly(rU)和poly(rG)，但不结合poly(rC)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.329; 覆盖度=114.247; E 值=4.99e-70; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009742 | brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.329; 覆盖度=114.247; E 值=4.99e-70; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015031 | protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051028 | mRNA transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900458 | negative regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.329; 覆盖度=114.247; E 值=4.99e-70; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005635 | nuclear envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005643 | nuclear pore | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.329; 覆盖度=114.247; E 值=4.99e-70; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.329; 覆盖度=114.247; E 值=4.99e-70; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G75340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.632; 覆盖度=121.37; E 值=1.66e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0704300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.329; 覆盖度=114.247; E 值=4.99e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |