基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002680 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:54526889-54528838 (-) |
| 描述 | Similar to SPX1: SPX domain-containing protein 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002680 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g20150 |
在植物适应磷酸盐饥饿方面发挥积极作用。 | |
At2g26660 |
可能以 Pi 依赖方式抑制 PHR1 的 DNA 结合活性。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0603600 |
参与植物对磷酸盐 饥饿的适应。 |
Regulation of OsSPX1 and OsSPX3 on expression of OsSPX domain genes and Pi-starvation signaling in rice.2009 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2009.00834.x OsSPX1 suppresses the function of OsPHR2 in the regulation of expression of OsPT2 and phosphate homeostasis in shoots of rice.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04170.x
|
UniProt: B8B4D0 |
参与植物对磷酸盐 (Pi) 缺乏的适应(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0202200 |
通过磷酸盐 依赖性蛋白质相互作用抑制 PHR2 DNA 结合活性。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016036 | cellular response to phosphate starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.48; 覆盖度=100.0; E 值=3.17e-123; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051511 | negative regulation of unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.403; 覆盖度=106.05; E 值=1.44e-110; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070417 | cellular response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.403; 覆盖度=106.05; E 值=1.44e-110; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071456 | cellular response to hypoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.48; 覆盖度=100.0; E 值=3.17e-123; UniProt GO evidence=HEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080040 | positive regulation of cellular response to phosphate starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.48; 覆盖度=100.0; E 值=3.17e-123; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000024 | regulation of leaf development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.403; 覆盖度=106.05; E 值=1.44e-110; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.48; 覆盖度=100.0; E 值=3.17e-123; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.323; 覆盖度=103.559; E 值=1.49e-118; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.48; 覆盖度=100.0; E 值=3.17e-123; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G26660 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.323; 覆盖度=103.559; E 值=1.49e-118 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G20150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.48; 覆盖度=100.0; E 值=3.17e-123 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0202200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=56.643; 覆盖度=101.779; E 值=2.64e-92 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0603600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.403; 覆盖度=106.05; E 值=1.44e-110 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |