基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002125 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:42190284-42192506 (-) |
| 描述 | Similar to IQD20: Protein IQ-DOMAIN 20 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002125 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g16490 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g51960 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g29150 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g14750 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g62070 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010091 | trichome branching | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.88; 覆盖度=96.57; E 值=1.39e-35; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051592 | response to calcium ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.979; 覆盖度=99.736; E 值=6.43e-26; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.213; 覆盖度=102.639; E 值=2.02e-89; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005635 | nuclear envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.495; 覆盖度=102.375; E 值=1.23e-50; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.979; 覆盖度=99.736; E 值=6.43e-26; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005856 | cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.213; 覆盖度=102.639; E 值=2.02e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.213; 覆盖度=102.639; E 值=2.02e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005516 | calmodulin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.213; 覆盖度=102.639; E 值=2.02e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G51960 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.495; 覆盖度=102.375; E 值=1.23e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G16490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.213; 覆盖度=102.639; E 值=2.02e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.88; 覆盖度=96.57; E 值=1.39e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G29150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.707; 覆盖度=108.179; E 值=2.21e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G62070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.979; 覆盖度=99.736; E 值=6.43e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |