基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002103 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:41688346-41688819 (+) |
| 描述 | Similar to RPS17: 30S ribosomal protein S17%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_002103 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g79850 |
作为主要的rRNA结合蛋白之一，它特异性结合16S核糖体RNA的5'-端（通过相似性）。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: Q9ZST1 |
主要的rRNA结合蛋白之一，特异性结合16S核糖体RNA的5'-端。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.798; 覆盖度=69.427; E 值=4.15e-41; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032544 | plastid translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000312 | plastid small ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005840 | ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.798; 覆盖度=69.427; E 值=4.15e-41; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.798; 覆盖度=69.427; E 值=4.15e-41; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019843 | rRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G79850 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=89.809; E 值=3.62e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0691600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.18; 覆盖度=77.707; E 值=2.15e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:542469 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=55.238; 覆盖度=66.879; E 值=1.48e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |