基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002078 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:41404832-41407728 (+) |
| 描述 | Similar to TGH: G patch domain-containing protein TGH (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_002078 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g23080 |
作为微小RNA (miRNA) 和小干扰RNA (siRNA) 生物合成的一个组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: B8B2G4 |
作为微小RNA (miRNA) 和小干扰RNA (siRNA) 生物合成的一个组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0489200 |
作为微小RNA (miRNA) 和小干扰RNA (siRNA) 生物合成的一个组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006396 | RNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010087 | phloem or xylem histogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030422 | siRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031047 | regulatory ncRNA-mediated gene silencing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=69.231; 覆盖度=87.313; E 值=1.49e-51; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035196 | miRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016607 | nuclear speck | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071013 | catalytic step 2 spliceosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.322; 覆盖度=90.299; E 值=7.68e-19; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070878 | primary miRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070883 | pre-miRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G23080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.795; 覆盖度=87.313; E 值=6.3e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bta:518738 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.6; 覆盖度=93.284; E 值=2.67e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0489200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=69.231; 覆盖度=87.313; E 值=1.7e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:67471 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.322; 覆盖度=90.299; E 值=7.68e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |