基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_001810 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:33948205-33949938 (+) |
| 描述 | Similar to DA2: E3 ubiquitin-protein ligase DA2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_001810 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g78420 |
E3 泛素-蛋白连接酶,参与器官和种子大小的调控。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g17145 |
E3 泛素-蛋白连接酶,参与器官和种子大小的调控。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0244100 |
参与谷粒大小调控的E3泛素蛋白连接酶。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A4GWX9 |
参与谷粒大小调控的E3泛素蛋白连接酶。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.803; 覆盖度=98.27; E 值=1.73e-100; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042149 | cellular response to glucose starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.426; 覆盖度=32.526; E 值=1.92e-12; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046620 | regulation of organ growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.803; 覆盖度=98.27; E 值=1.73e-100; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080113 | regulation of seed growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.803; 覆盖度=98.27; E 值=1.73e-100; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.803; 覆盖度=98.27; E 值=1.73e-100; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.803; 覆盖度=98.27; E 值=1.73e-100; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.803; 覆盖度=98.27; E 值=1.73e-100; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ago:AGOS_ADR255W | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.426; 覆盖度=32.526; E 值=1.92e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G17145 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.124; 覆盖度=94.81; E 值=1.36e-86 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G78420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.803; 覆盖度=98.27; E 值=1.73e-100 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0244100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.423; 覆盖度=100.692; E 值=1.76e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |