基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_001698 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:31507739-31514919 (+) |
| 描述 | Similar to At4g34450: Coatomer subunit gamma (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_001698 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g34450 |
包裹体是一个胞质蛋白复合物,可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合,进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0201100 |
包裹体是一个胞质蛋白复合物,可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合,进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0227000 |
包裹体是一个胞质蛋白复合物,可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合,进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006886 | intracellular protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006888 | endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006891 | intra-Golgi vesicle-mediated transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009306 | protein secretion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0072384 | organelle transport along microtubule | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.738; 覆盖度=98.326; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005793 | endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.081; 覆盖度=98.103; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030126 | COPI vesicle coat | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005198 | structural molecule activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G34450 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.256; 覆盖度=98.996; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bta:536616 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.081; 覆盖度=98.103; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0227000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.949; 覆盖度=98.772; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0201100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.227; 覆盖度=98.214; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |