基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_001310 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:23895449-23904895 (-) |
| 描述 | Similar to PARP2: Poly [ADP-ribose] polymerase 2 (Zea mays OX%3D4577) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_001310 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g02390 |
参与碱基切除修复(BER)途径,通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0351200 |
参与碱基切除修复(BER)途径,通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0351100 |
参与碱基切除修复(BER)途径,通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006302 | double-strand break repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006303 | double-strand break repair via nonhomologous end joining | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.447; 覆盖度=48.875; E 值=1.68e-141; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030592 | DNA ADP-ribosylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.447; 覆盖度=48.875; E 值=1.68e-141; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070212 | protein poly-ADP-ribosylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.447; 覆盖度=48.875; E 值=1.68e-141; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003950 | NAD+ poly-ADP-ribosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016779 | nucleotidyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140806 | NAD+-protein-aspartate ADP-ribosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140807 | NAD+-protein-glutamate ADP-ribosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990404 | NAD+-protein mono-ADP-ribosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.23; 覆盖度=49.035; E 值=1.82e-147; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G02390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.447; 覆盖度=48.875; E 值=1.68e-141 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0351200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.902; 覆盖度=49.035; E 值=9.27e-146 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |