基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000777 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:14274603-14275127 (-) |
| 描述 | Similar to IBH1: Transcription factor IBH1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000777 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g43060 |
非典型且可能不与 DNA 结合的 bHLH 转录因子,作为转录抑制因子,在响应赤霉素 (GA) 和油菜素甾醇 (BR) 信号时负向调控细胞和器官伸长。 |
Antagonistic HLH/bHLH transcription factors mediate brassinosteroid regulation of cell elongation and plant development in rice and Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.070441 A triantagonistic basic helix-loop-helix system regulates cell elongation in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.105023
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0660100 |
非典型且可能不与DNA结合的bHLH转录因子,作为细胞延长和植物发育的负调控因子。 | |
UniProt: Q01I07 |
非典型且可能不与DNA结合的bHLH转录因子,作为细胞延长和植物发育的负调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.744; 覆盖度=89.655; E 值=1.58e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=30.12; 覆盖度=95.402; E 值=1.35e-08; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009740 | gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.744; 覆盖度=89.655; E 值=1.58e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009741 | response to brassinosteroid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=30.12; 覆盖度=95.402; E 值=1.35e-08; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009742 | brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.744; 覆盖度=89.655; E 值=1.58e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009826 | unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=30.12; 覆盖度=95.402; E 值=1.35e-08; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.744; 覆盖度=89.655; E 值=1.58e-18; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.744; 覆盖度=89.655; E 值=1.58e-18; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.744; 覆盖度=89.655; E 值=1.58e-18; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046983 | protein dimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.744; 覆盖度=89.655; E 值=1.58e-18; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G43060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.744; 覆盖度=89.655; E 值=1.58e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0660100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=30.12; 覆盖度=95.402; E 值=1.35e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |