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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_000397
当前查询版本OH1004
位置Chr01:7393712-7395485 (-)
描述Similar to GSVIVT00026920001: Probable polygalacturonase (Vitis vinifera OX%3D29760)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_000397 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g80170 可能是多聚半乳糖醛酸酶At1g80170。 暂无已核实直接文献
At1g02790 可能在花粉发育、萌发和花粉管生长过程中参与果胶的解聚功能。 暂无已核实直接文献
At3g15720 可能的聚半乳糖醛酸酶At3g15720。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0005975carbohydrate metabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=26.923; 覆盖度=65.823; E 值=1.54e-19; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045490pectin catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.415; 覆盖度=45.781; E 值=2.16e-14; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0071555cell wall organization生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.41; 覆盖度=70.042; E 值=9.95e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005576extracellular region细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.41; 覆盖度=70.042; E 值=9.95e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.415; 覆盖度=45.781; E 值=2.16e-14; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009505plant-type cell wall细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.415; 覆盖度=45.781; E 值=2.16e-14; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016020membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=26.923; 覆盖度=65.823; E 值=1.54e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004650polygalacturonase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=26.923; 覆盖度=65.823; E 值=1.54e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0033917exo-poly-alpha-galacturonosidase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.41; 覆盖度=70.042; E 值=9.95e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0047911galacturan 1,4-alpha-galacturonidase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.944; 覆盖度=89.873; E 值=1.14e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G02790KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.944; 覆盖度=89.873; E 值=1.14e-14UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G80170KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.575; 覆盖度=82.489; E 值=1.01e-14UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G15720KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.415; 覆盖度=45.781; E 值=2.16e-14UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release