基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000359 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:6589973-6592432 (-) |
| 描述 | Similar to TFIIB2: Transcription initiation factor IIB-2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_000359 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 16 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g10330 |
在由 RNA 聚合酶 II 转录的真核基因激活中起主要作用的一般因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g41630 |
一种通用因子，在由RNA聚合酶II转录的真核基因激活中起主要作用（通过相似性）。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0534800 |
在 RNA 聚合酶 II 转录的真核基因激活中起主要作用的通用因子。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0001174 | transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.986; 覆盖度=94.872; E 值=5.55e-85; UniProt GO evidence=IDA:FlyBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006352 | DNA-templated transcription initiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006367 | transcription initiation at RNA polymerase II promoter | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.986; 覆盖度=94.872; E 值=5.55e-85; UniProt GO evidence=ISS:FlyBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009960 | endosperm development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=82.051; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010183 | pollen tube guidance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=82.051; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042789 | mRNA transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.986; 覆盖度=94.872; E 值=5.55e-85; UniProt GO evidence=IDA:FlyBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051123 | RNA polymerase II preinitiation complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.986; 覆盖度=94.872; E 值=5.55e-85; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070897 | transcription preinitiation complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080092 | regulation of pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=82.051; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0097550 | transcription preinitiation complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016251 | RNA polymerase II general transcription initiation factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017025 | TBP-class protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061733 | protein-lysine-acetyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.986; 覆盖度=94.872; E 值=5.55e-85; UniProt GO evidence=ISS:FlyBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G41630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=82.051; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G10330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.385; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dme:Dmel_CG5193 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.986; 覆盖度=94.872; E 值=5.55e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:548070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.818; 覆盖度=100.321; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |