基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000083 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:1946228-1949243 (-) |
| 描述 | Similar to IRK: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000083 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g56370 |
可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶IRK。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g01890 |
富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶,可能参与维管组织发育。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g28040 |
可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At3g28040。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g12460 |
可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g12460。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g44700 |
与 GSO1 一起,是在胚胎和子叶表皮表面发育过程中所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。 |
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0048364 | root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.38; 覆盖度=98.063; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051302 | regulation of cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.38; 覆盖度=98.063; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090511 | periclinal cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.38; 覆盖度=98.063; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.38; 覆盖度=98.063; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.276; 覆盖度=84.302; E 值=4.2e-138; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004672 | protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.413; 覆盖度=96.942; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.38; 覆盖度=98.063; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.38; 覆盖度=98.063; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.38; 覆盖度=98.063; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G12460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.276; 覆盖度=84.302; E 值=4.2e-138 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G28040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.756; 覆盖度=100.612; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G56370 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.38; 覆盖度=98.063; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G01890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.413; 覆盖度=96.942; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |