基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G318480 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:82334432-82339797 (+) |
| 描述 | Similar to SCAB1: Stomatal closure-related actin-binding protein 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_033946 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g26770 |
植物特异性肌动蛋白结合蛋白,可捆绑和稳定微丝。 | |
At4g34350 |
用于类异戊二烯生物合成的质体非甲羟戊酸途径的酶,可将 1-羟基-2-甲基-2--丁烯基 4-二磷酸转化为异戊烯基二磷酸 和二甲基烯丙基二磷酸。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0731900 |
质体非甲羟戊酸途径中的异戊二烯类生物合成酶,将1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基4-二磷酸转化为异戊烯基二磷酸(IPP)和二甲基烯丙基二磷酸(DMAPP)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007015 | actin filament organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.085; 覆盖度=55.294; E 值=3.36e-15; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010119 | regulation of stomatal movement | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.085; 覆盖度=55.294; E 值=3.36e-15; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.085; 覆盖度=55.294; E 值=3.36e-15; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.447; 覆盖度=55.294; E 值=1.78e-06; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005856 | cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.085; 覆盖度=55.294; E 值=3.36e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003779 | actin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.085; 覆盖度=55.294; E 值=3.36e-15; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G26770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.085; 覆盖度=55.294; E 值=3.36e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G40820 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.447; 覆盖度=55.294; E 值=1.78e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |