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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA08G003540
当前查询版本TK1151
位置Chr08:903739-905393 (+)
描述Similar to DOF4.6: Dof zinc finger protein DOF4.6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_021575 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 16 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g55370 与 5'-AA[AG]G-3' 共有核心序列特异性结合的转录因子。
At2g46590 特异性参与种子萌发母本调控的转录因子。 暂无已核实直接文献
At3g61850 特异性参与种子萌发母本调控的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g60200 转录因子,能够特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列(通过相似性推测)。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0567800 可能在发育中的种子中转录激活种子储存蛋白基因的转录因子。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.714; 覆盖度=120.132; E 值=4.99e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006355regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.714; 覆盖度=120.132; E 值=4.99e-44; UniProt GO evidence=TAS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009639response to red or far red light生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.948; 覆盖度=95.38; E 值=4.07e-40; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009640photomorphogenesis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=77.612; 覆盖度=22.112; E 值=1.27e-30; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009845seed germination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.948; 覆盖度=95.38; E 值=4.07e-40; UniProt GO evidence=IMP:TIGRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010087phloem or xylem histogenesis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.476; 覆盖度=27.723; E 值=1.96e-32; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045892negative regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.948; 覆盖度=95.38; E 值=4.07e-40; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045893positive regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=77.612; 覆盖度=22.112; E 值=1.27e-30; UniProt GO evidence=IEP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048364root development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.476; 覆盖度=27.723; E 值=1.96e-32; UniProt GO evidence=IEP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090057root radial pattern formation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.476; 覆盖度=27.723; E 值=1.96e-32; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.714; 覆盖度=120.132; E 值=4.99e-44; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000976transcription cis-regulatory region binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.948; 覆盖度=95.38; E 值=4.07e-40; UniProt GO evidence=IPI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.714; 覆盖度=120.132; E 值=4.99e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003682chromatin binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.948; 覆盖度=95.38; E 值=4.07e-40; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003700DNA-binding transcription factor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.714; 覆盖度=120.132; E 值=4.99e-44; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.714; 覆盖度=120.132; E 值=4.99e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G55370KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=77.612; 覆盖度=22.112; E 值=1.27e-30UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G61850KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.948; 覆盖度=95.38; E 值=4.07e-40UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G24060KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.714; 覆盖度=120.132; E 值=4.99e-44UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G60200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.476; 覆盖度=27.723; E 值=1.96e-32UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os04g0567800KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.608; 覆盖度=111.221; E 值=3.54e-32UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release