基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G360780 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:90406314-90409300 (-) |
| 描述 | Similar to SGRL: Magnesium dechelatase SGRL%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029939 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g44000 |
镁螯合酶参与光系统 I 和光系统 II 叶绿素-蛋白质复合物中叶绿素 a 的降解。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2Z3E5 |
参与类囊体膜中光系统II(LHCPII)完整光捕获复合体的解离机制。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0532000 |
参与类囊体膜中光系统II(LHCII)完整光捕获复合体的拆解机制。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0692600 |
促进叶片叶绿素的降解。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.274; 覆盖度=92.857; E 值=3.8e-76; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010271 | regulation of chlorophyll catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.851; 覆盖度=69.048; E 值=5.23e-53; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015996 | chlorophyll catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.274; 覆盖度=92.857; E 值=3.8e-76; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.274; 覆盖度=92.857; E 值=3.8e-76; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.488; 覆盖度=65.079; E 值=1.59e-54; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.274; 覆盖度=92.857; E 值=3.8e-76; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.488; 覆盖度=65.079; E 值=1.62e-54; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.488; 覆盖度=65.079; E 值=1.62e-54; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016829 | lyase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.274; 覆盖度=92.857; E 值=3.8e-76; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G44000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.274; 覆盖度=92.857; E 值=3.8e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cann:107866321 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.895; 覆盖度=75.397; E 值=8.83e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0532000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.488; 覆盖度=65.079; E 值=1.62e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |