基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G051030 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:13548348-13554125 (-) |
| 描述 | Similar to SCAR3: Protein SCAR3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_027339 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g29170 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g34150 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g18600 |
含瘢痕样结构域的蛋白 WAVE 5。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g38440 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0208600 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0030036 | actin cytoskeleton organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051127 | positive regulation of actin nucleation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000601 | positive regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.808; 覆盖度=22.587; E 值=7.22e-70; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005856 | cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.808; 覆盖度=22.587; E 值=7.22e-70; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.251; 覆盖度=58.643; E 值=1.38e-83; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.251; 覆盖度=58.643; E 值=1.38e-83; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031209 | SCAR complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071944 | cell periphery | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.251; 覆盖度=58.643; E 值=1.38e-83; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003779 | actin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003785 | actin monomer binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.251; 覆盖度=58.643; E 值=1.38e-83; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034237 | protein kinase A regulatory subunit binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071933 | Arp2/3 complex binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G29170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.011; 覆盖度=114.74; E 值=1.96e-135 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G34150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.251; 覆盖度=58.643; E 值=1.38e-83 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G18600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.808; 覆盖度=22.587; E 值=7.22e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |