基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA06G212940 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr06:55157908-55158897 (+) |
| 描述 | Similar to Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain (Nicotiana tabacum OX%3D4097) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_023827 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g27060 |
提供 DNA 合成所需的前体。 | |
UniProt: P0DKH3 |
提供 DNA 合成所需的前体。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g23580 |
提供 DNA 合成所需的前体。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006260 | DNA replication | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=85.843; 覆盖度=100.912; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=85.843; 覆盖度=100.912; E 值=0.0; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009259 | ribonucleotide metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=73.765; 覆盖度=98.48; E 值=1.45e-180; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009263 | deoxyribonucleotide biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.578; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0012501 | programmed cell death | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=85.843; 覆盖度=100.912; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051726 | regulation of cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=85.843; 覆盖度=100.912; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=85.843; 覆盖度=100.912; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.578; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=70.679; 覆盖度=98.48; E 值=1.06e-167; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005971 | ribonucleoside-diphosphate reductase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=73.765; 覆盖度=98.48; E 值=1.45e-180; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004748 | ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.578; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.578; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G23580 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=73.765; 覆盖度=98.48; E 值=1.45e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G27060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=85.843; 覆盖度=100.912; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107781035 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=90.578; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |