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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA04G117950
当前查询版本TK1151
位置Chr04:30671656-30676496 (-)
描述Similar to PPR4: Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g04810%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_035634 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g04810 可能在质体核糖体生物发生中起作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0008380RNA splicing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.082; 覆盖度=81.896; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009793embryo development ending in seed dormancy生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.16; 覆盖度=69.01; E 值=2.1e-66; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009880embryonic pattern specification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.082; 覆盖度=81.896; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010239chloroplast mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.16; 覆盖度=69.01; E 值=2.1e-66; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048366leaf development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.082; 覆盖度=81.896; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.555; 覆盖度=52.609; E 值=2.28e-63; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005783endoplasmic reticulum细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.555; 覆盖度=52.609; E 值=2.28e-63; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005794Golgi apparatus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.555; 覆盖度=52.609; E 值=2.28e-63; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.082; 覆盖度=81.896; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042644chloroplast nucleoid细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.16; 覆盖度=69.01; E 值=2.1e-66; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.082; 覆盖度=81.896; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G05670KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.555; 覆盖度=52.609; E 值=2.28e-63UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G53700KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.16; 覆盖度=69.01; E 值=2.1e-66UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G04810KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.082; 覆盖度=81.896; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release