基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G449250 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:114269311-114269766 (+) |
| 描述 | Similar to NFYB8: Nuclear transcription factor Y subunit B-8 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012655 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g14540 |
NF-Y/HAP 转录因子复合物的组分(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g47640 |
NF-Y/HAP 转录因子复合物的组分(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0174500 |
可能参与长日照(LD)条件下开花时间调控的转录因子。 | |
Os03g0413000 |
NF-Y/HAP转录因子复合物的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0606600 |
NF-Y/HAP转录因子复合物的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019760 | glucosinolate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.279; 覆盖度=69.636; E 值=1.84e-69; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016602 | CCAAT-binding factor complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.279; 覆盖度=69.636; E 值=1.84e-69; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001228 | DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046982 | protein heterodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G37060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.399; 覆盖度=74.089; E 值=3.02e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G53340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.279; 覆盖度=69.636; E 值=1.84e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0834400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=63.975; 覆盖度=65.182; E 值=2.84e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:9268669 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=72.535; 覆盖度=57.49; E 值=1.82e-65 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |