RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDTkA01G602290
当前查询版本TK1151
位置Chr01:151746714-151747630 (-)
描述Similar to LUX: Transcription factor LUX (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000571 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g59570 转录因子，是昼夜节律调控回路的关键组成部分。 暂无已核实直接文献
At3g46640 对昼夜节律振荡的产生至关重要的转录因子。
PHYTOCLOCK 1 encoding a novel GARP protein essential for the Arabidopsis circadian clock.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-2443.2005.00892.x
LUX ARRHYTHMO encodes a nighttime repressor of circadian gene expression in the Arabidopsis core clock.2011 · DOI: 10.1016/j.cub.2010.12.021
At2g40970 可能的转录因子，通过 CBF 非依赖途径作为低温耐受性的负调控因子。
A single-repeat R3-MYB transcription factor MYBC1 negatively regulates freezing tolerance in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2010.03.114

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0971800 对昼夜节律振荡的产生至关重要的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XE31 可结合特定DNA序列的转录激活因子。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0000122negative regulation of transcription by RNA polymerase II生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=IDA:ComplexPortalUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000160phosphorelay signal transduction system生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.088; 覆盖度=56.066; E 值=6.5e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006355regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=TAS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0007623circadian rhythm生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009409response to cold生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.098; 覆盖度=40.0; E 值=2.99e-31; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009736cytokinin-activated signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.088; 覆盖度=56.066; E 值=6.5e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009909regulation of flower development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.592; 覆盖度=64.262; E 值=7.69e-57; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010468regulation of gene expression生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042752regulation of circadian rhythm生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=IDA:ComplexPortalUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042753positive regulation of circadian rhythm生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003700DNA-binding transcription factor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G40970KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.098; 覆盖度=40.0; E 值=2.99e-31UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G46640KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.763; 覆盖度=96.721; E 值=1.73e-60UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G59570KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.592; 覆盖度=64.262; E 值=7.69e-57UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os02g0796500KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.088; 覆盖度=56.066; E 值=6.5e-21UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release