基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G602250 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:151732681-151737462 (+) |
| 描述 | Similar to APUM1: Pumilio homolog 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000573 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g29200 |
通过结合靶 mRNA 的 3'-UTR 调节翻译和 mRNA 稳定性的序列特异性 RNA 结合蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g29140 |
通过结合靶 mRNA 的 3'-UTR 调节翻译和 mRNA 稳定性的序列特异性 RNA 结合蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g29190 |
通过结合靶 mRNA 的 3'-UTR 调节翻译和 mRNA 稳定性的序列特异性 RNA 结合蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g10360 |
通过结合靶 mRNA 的 3'-UTR 调节翻译和 mRNA 稳定性的序列特异性 RNA 结合蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g20250 |
通过结合靶 mRNA 的 3'-UTR 调节翻译和 mRNA 稳定性的序列特异性 RNA 结合蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006417 | regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.36; 覆盖度=109.188; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010608 | post-transcriptional regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.36; 覆盖度=109.188; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.36; 覆盖度=109.188; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.176; 覆盖度=109.402; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.36; 覆盖度=109.188; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003730 | mRNA 3'-UTR binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.176; 覆盖度=109.402; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G29140 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.796; 覆盖度=108.761; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G29190 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.176; 覆盖度=109.402; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G29200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.36; 覆盖度=109.188; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G10360 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=57.988; 覆盖度=54.167; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |