基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G436420 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:109036625-109040526 (+) |
| 描述 | Similar to BASS2: Sodium/pyruvate cotransporter BASS2%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002606 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g26900 |
钠偶联代谢物转运蛋白,在丙酮酸穿过叶绿体包膜的转运中起着至关重要的作用。 | |
At1g78560 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0645200 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0381100 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0475400 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006849 | plasma membrane pyruvate transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.177; 覆盖度=101.928; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098717 | pantothenate import across plasma membrane | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.97; 覆盖度=80.723; E 值=8.85e-87; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.177; 覆盖度=101.928; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.177; 覆盖度=101.928; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.177; 覆盖度=101.928; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.177; 覆盖度=101.928; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015293 | symporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.636; 覆盖度=83.373; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050833 | pyruvate transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.177; 覆盖度=101.928; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G78560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.97; 覆盖度=80.723; E 值=8.85e-87 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G26900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.177; 覆盖度=101.928; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0645200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.636; 覆盖度=83.373; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0475400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.06; 覆盖度=72.771; E 值=6.42e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0381100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.474; 覆盖度=75.181; E 值=2.26e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4335634 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.474; 覆盖度=75.181; E 值=2.26e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |