基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G029430 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:7548225-7548554 (+) |
| 描述 | Similar to CRD1: Magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester [oxidative] cyclase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_039327 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g56940 |
MgProto 单甲酯 环化酶复合物的催化成分，可催化叶绿素生物合成中等环的形成。 |
Arabidopsis CHL27, located in both envelope and thylakoid membranes, is required for the synthesis of protochlorophyllide.2003 · DOI: 10.1073/pnas.2136793100
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015979 | photosynthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015995 | chlorophyll biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901401 | regulation of tetrapyrrole metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009706 | chloroplast inner membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=82.653; 覆盖度=88.288; E 值=9.98e-53; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048529 | magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G56940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=89.796; 覆盖度=88.288; E 值=7.39e-57 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cre:CHLRE_12g510050v5 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=74.038; 覆盖度=93.694; E 值=1.13e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |