基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G020610 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:5319353-5332210 (+) |
| 描述 | Similar to YSL3: Metal-nicotianamine transporter YSL3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005725 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g53550 |
可能参与烟草胺螯合金属在维管组织中的横向转运。 | |
At4g24120 |
参与种子的铁加载。 | |
At5g24380 |
可能参与烟草胺螯合金属在维管组织中的横向转运。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0542200 |
可能参与烟草胺螯合金属的转运。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0542800 |
可能参与烟草胺螯合金属的转运。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0003006 | developmental process involved in reproduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006811 | monoatomic ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.464; 覆盖度=61.138; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006826 | iron ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009624 | response to nematode | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010039 | response to iron ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010043 | response to zinc ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.464; 覆盖度=61.138; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048316 | seed development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035673 | oligopeptide transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G24120 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.349; 覆盖度=61.825; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G24380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.464; 覆盖度=61.138; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G53550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.71; 覆盖度=60.844; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0542200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=55.089; 覆盖度=60.746; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0542800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=56.427; 覆盖度=58.783; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |