基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G014030 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:3639155-3641553 (+) |
| 描述 | Similar to ACS12: Probable aminotransferase ACS12 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005826 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g51690 |
可能的氨基转移酶。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g62960 |
可能的氨基转移酶。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g37770 |
1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶(ACS)酶催化 S-腺苷-L-蛋氨酸(SAM)转化为 1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC),乙烯的直接前体。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0130400 |
催化1-氨基环丙烷-1-羧酸的形成,这是高等植物中乙烯的直接前体(通过相似性)。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006520 | amino acid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.469; 覆盖度=96.97; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009693 | ethylene biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.469; 覆盖度=96.97; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009835 | fruit ripening | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.131; 覆盖度=80.682; E 值=3.07e-130; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.348; 覆盖度=95.833; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033097 | amyloplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.469; 覆盖度=96.97; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008483 | transaminase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.469; 覆盖度=96.97; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016847 | 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.469; 覆盖度=96.97; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030170 | pyridoxal phosphate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.469; 覆盖度=96.97; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.131; 覆盖度=80.682; E 值=3.07e-130; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G62960 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.545; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G37770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.131; 覆盖度=80.682; E 值=3.07e-130 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G51690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.348; 覆盖度=95.833; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0130400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.469; 覆盖度=96.97; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:547976 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.787; 覆盖度=77.462; E 值=5.15e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4340002 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.469; 覆盖度=96.97; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |