基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G008450 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:2219600-2221789 (+) |
| 描述 | Similar to At3g06270: Probable protein phosphatase 2C 35 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005903 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g06270 |
可能的蛋白磷酸酶2C 35。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q9SL76 |
蛋白磷酸酶2C以及含环状核苷酸结合/激酶结构域的蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g03415 |
可能的蛋白磷酸酶2C 52。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0646100 |
可能的蛋白磷酸酶 2C 65。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0566200 |
可能的蛋白磷酸酶 2C 64。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.647; 覆盖度=13.207; E 值=3.47e-140; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009626 | plant-type hypersensitive response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.18; 覆盖度=34.139; E 值=1.25e-139; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019677 | NAD+ catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.205; 覆盖度=33.664; E 值=7.93e-135; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043068 | positive regulation of programmed cell death | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.205; 覆盖度=33.664; E 值=7.93e-135; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050832 | defense response to fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.205; 覆盖度=33.664; E 值=7.93e-135; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.205; 覆盖度=33.664; E 值=7.93e-135; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.18; 覆盖度=34.139; E 值=1.25e-139; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003953 | NAD+ nucleosidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.205; 覆盖度=33.664; E 值=7.93e-135; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.647; 覆盖度=13.207; E 值=3.47e-140; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.18; 覆盖度=34.139; E 值=1.25e-139; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043531 | ADP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.18; 覆盖度=34.139; E 值=1.25e-139; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.647; 覆盖度=13.207; E 值=3.47e-140; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050135 | NADP+ nucleosidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.205; 覆盖度=33.664; E 值=7.93e-135; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061809 | NAD+ nucleosidase activity, cyclic ADP-ribose generating | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.18; 覆盖度=34.139; E 值=1.25e-139; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G06270 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.647; 覆盖度=13.207; E 值=3.47e-140 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |