基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_039376 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | JAJTUU010000010.1:5344012-5348986 (-) |
| 描述 | Similar to At1g78910: RNA pseudouridine synthase 3%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_039376 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000455 | enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.336; 覆盖度=40.847; E 值=7.16e-89; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.336; 覆盖度=40.847; E 值=7.16e-89; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.336; 覆盖度=40.847; E 值=7.16e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.254; 覆盖度=40.0; E 值=9.98e-41; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.336; 覆盖度=40.847; E 值=7.16e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009982 | pseudouridine synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.336; 覆盖度=40.847; E 值=7.16e-89; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G78910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.336; 覆盖度=40.847; E 值=7.16e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G19440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.254; 覆盖度=40.0; E 值=9.98e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0520100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=61.277; 覆盖度=39.831; E 值=2.89e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |