基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_038005 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr09:28004156-28007275 (+) |
| 描述 | Similar to At5g48130: BTB/POZ domain-containing protein At5g48130 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_038005 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g48130 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g13600 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g67385 |
可能作为E3泛素蛋白连接酶复合体(CUL3-RBX1-BTB)的底物特异性衔接蛋白,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g30440 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g67440 |
可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器,介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009904 | chloroplast accumulation movement | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.377; 覆盖度=75.883; E 值=2.65e-67; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009911 | positive regulation of flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009958 | positive gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.659; 覆盖度=97.235; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042742 | defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.377; 覆盖度=75.883; E 值=2.65e-67; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071365 | cellular response to auxin stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901703 | protein localization involved in auxin polar transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000012 | regulation of auxin polar transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.102; 覆盖度=78.034; E 值=3.55e-65; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.377; 覆盖度=75.883; E 值=2.65e-67; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071944 | cell periphery | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G30440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.102; 覆盖度=78.034; E 值=3.55e-65 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G13600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.884; 覆盖度=84.793; E 值=1.66e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.659; 覆盖度=97.235; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G67385 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.377; 覆盖度=75.883; E 值=2.65e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G67440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.211; 覆盖度=72.965; E 值=1.81e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |