本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_033947
当前查询版本OH1004
位置Chr07:67678877-67679283 (+)
描述Similar to ISPH: 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_033947 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34350 用于类异戊二烯生物合成的质体非甲羟戊酸途径的酶,可将 1-羟基-2-甲基-2--丁烯基 4-二磷酸转化为异戊烯基二磷酸 和二甲基烯丙基二磷酸。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0731900 质体非甲羟戊酸途径中的异戊二烯类生物合成酶,将1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基4-二磷酸转化为异戊烯基二磷酸(IPP)和二甲基烯丙基二磷酸(DMAPP)。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0016114terpenoid biosynthetic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.161; 覆盖度=132.857; E 值=1.13e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRuleUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0019288isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.579; 覆盖度=135.714; E 值=3.1e-21; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0050992dimethylallyl diphosphate biosynthetic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.579; 覆盖度=135.714; E 值=3.1e-21; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.526; 覆盖度=135.714; E 值=4.15e-21; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.526; 覆盖度=135.714; E 值=4.15e-21; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009570chloroplast stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.579; 覆盖度=135.714; E 值=3.1e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:00464294-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase activity (ferredoxin)分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.526; 覆盖度=135.714; E 值=4.15e-21; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0046872metal ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.579; 覆盖度=135.714; E 值=3.1e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:00515394 iron, 4 sulfur cluster binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.579; 覆盖度=135.714; E 值=3.1e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:00517454-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.579; 覆盖度=135.714; E 值=3.1e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G34350KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.526; 覆盖度=135.714; E 值=4.15e-21UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os03g0731900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.474; 覆盖度=135.714; E 值=8.86e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGgvi:glr3299KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.161; 覆盖度=132.857; E 值=1.13e-17UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGtel:tlr1041KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.745; 覆盖度=134.286; E 值=2.35e-17UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release