基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_032178 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:17851847-17853220 (+) |
| 描述 | Similar to IRT1: Fe(2+) transport protein 1 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032178 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g04032 |
可能介导从根际吸收锌。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g31260 |
可能介导从根际吸收锌。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g45105 |
可能介导从根际吸收锌。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0667500 |
铁转运蛋白参与从根际穿过根表皮层质膜吸收铁。 | |
Os03g0667300 |
铁转运蛋白,可能在根际表皮层质膜从根际吸收铁中发挥作用。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006826 | iron ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.061; 覆盖度=93.182; E 值=2.29e-136; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006829 | zinc ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.061; 覆盖度=93.182; E 值=2.29e-136; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015691 | cadmium ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.061; 覆盖度=93.182; E 值=2.29e-136; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071577 | zinc ion transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.061; 覆盖度=93.182; E 值=2.29e-136; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.061; 覆盖度=93.182; E 值=2.29e-136; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.972; 覆盖度=102.841; E 值=1.63e-132; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005385 | zinc ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.061; 覆盖度=93.182; E 值=2.29e-136; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G31260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.133; 覆盖度=106.534; E 值=1.68e-129 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G04032 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.972; 覆盖度=102.841; E 值=1.63e-132 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0667300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.657; 覆盖度=100.284; E 值=4.73e-133 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0667500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.061; 覆盖度=93.182; E 值=2.29e-136 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |