基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_031486 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:6662036-6663284 (+) |
| 描述 | Similar to SKIP6: F-box/kelch-repeat protein SKIP6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_031486 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g21950 |
F-box/kelch重复蛋白 SKIP6。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g39550 |
SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分,可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g49000 |
F-盒/凯尔希重复蛋白At5g49000。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g39590 |
F-box/kelch重复蛋白 At4g39590。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g39580 |
F-box/kelch重复蛋白At4g39580。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.478; 覆盖度=94.49; E 值=7.13e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.011; 覆盖度=99.449; E 值=8.23e-57; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.478; 覆盖度=94.49; E 值=7.13e-116; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G21950 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.478; 覆盖度=94.49; E 值=7.13e-116 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G39550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.011; 覆盖度=99.449; E 值=8.23e-57 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G39580 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.653; 覆盖度=94.49; E 值=1.82e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G39590 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.905; 覆盖度=92.837; E 值=1.06e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G49000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.228; 覆盖度=92.011; E 值=7.86e-48 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |