基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030713 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:121251815-121254315 (+) |
| 描述 | Similar to DXR: 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030713 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g62790 |
质体非甲羟戊酸途径中的异戊二烯类生物合成酶,催化NADPH依赖的1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸(DXP)重排及还原,生成2-C-甲基-D-赤藓醇4-磷酸(MEP)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0106900 |
质体非甲羟戊酸途径中的异戊二烯类生物合成酶,催化NADPH依赖的1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸(DXP)重排及还原,生成2-C-甲基-D-赤藓醇4-磷酸(MEP)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0008299 | isoprenoid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019288 | isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051484 | isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway involved in terpenoid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030145 | manganese ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030604 | 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070402 | NADPH binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | amr:AM1_0563 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.412; 覆盖度=83.087; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G62790 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.655; 覆盖度=98.732; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0106900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=81.505; 覆盖度=98.309; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |