基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030630 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:119893045-119895257 (-) |
| 描述 | Similar to AGL65: Agamous-like MADS-box protein AGL65 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030630 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g18750 |
可能的转录因子,与 MADS-box 蛋白 AGL104 形成异源二聚体,参与花粉发育晚期的成熟调控及花粉管生长。 | |
At2g03060 |
可能的转录因子,与 MADS-box 蛋白 AGL66 和 AGL104 形成异二聚体,参与花粉发育后期花粉成熟和花粉管生长的调节。 | |
At1g77980 |
可能的转录因子,与 MADS-box 蛋白 AGL30 形成异二聚体,参与花粉发育后期花粉成熟和花粉管生长的调节。 | |
At1g22130 |
可能的转录因子,与 MADS-box 蛋白 AGL30 和 AGL65 形成异二聚体,参与花粉发育后期花粉成熟和花粉管生长的调节。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0108900 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.83; 覆盖度=52.368; E 值=4.41e-29; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009555 | pollen development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010152 | pollen maturation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080092 | regulation of pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000978 | RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046983 | protein dimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G18750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.443; 覆盖度=84.958; E 值=8.7e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G22130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.764; 覆盖度=49.582; E 值=3.95e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G77980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.83; 覆盖度=52.368; E 值=4.41e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G03060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.516; 覆盖度=71.309; E 值=4.3e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0108900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.0; 覆盖度=22.284; E 值=9.42e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |