基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030582 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:119176886-119179509 (+) |
| 描述 | Similar to Os08g0135800: Zinc finger CCCH domain-containing protein 55 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_030582 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g18640 |
含锌指 CCCH 结构域的蛋白 38。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g33835 |
转录激活因子，参与 FRIGIDA 介导的春化途径，但不参与自主开花途径。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0135800 |
含锌指 CCCH 结构域的蛋白 55。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0497500 |
含锌指CCCH结构域的蛋白质36。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006396 | RNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006874 | intracellular calcium ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06; UniProt GO evidence=ISO:MGI | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008285 | negative regulation of cell population proliferation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06; UniProt GO evidence=ISO:MGI | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.851; 覆盖度=24.802; E 值=7.62e-16; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010220 | positive regulation of vernalization response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.851; 覆盖度=24.802; E 值=7.62e-16; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.851; 覆盖度=24.802; E 值=7.62e-16; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051209 | release of sequestered calcium ion into cytosol | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.977; 覆盖度=11.478; E 值=1.89e-17; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06; UniProt GO evidence=ISO:MGI | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048471 | perinuclear region of cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.5; 覆盖度=26.385; E 值=9.17e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.5; 覆盖度=26.385; E 值=9.17e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0044325 | transmembrane transporter binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G33835 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.851; 覆盖度=24.802; E 值=7.62e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G18640 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.977; 覆盖度=11.478; E 值=1.89e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0497500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=32.836; 覆盖度=26.517; E 值=1.31e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0135800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.5; 覆盖度=26.385; E 值=9.17e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:27967 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.176; 覆盖度=8.971; E 值=1.09e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |