基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029803 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:100724251-100724973 (+) |
| 描述 | Similar to ERF2: Ethylene-responsive transcription factor 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029803 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g47220 |
作为转录激活剂。 | |
At4g17500 |
作为转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=IDA:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.046; 覆盖度=99.583; E 值=2.92e-66; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009624 | response to nematode | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.046; 覆盖度=99.583; E 值=2.92e-66; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009864 | induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009873 | ethylene-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010087 | phloem or xylem histogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G17500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.046; 覆盖度=99.583; E 值=2.92e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G47220 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.717; 覆盖度=88.333; E 值=2.85e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nsy:104217398 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.711; 覆盖度=87.917; E 值=4.76e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107769743 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.97; 覆盖度=84.167; E 值=2.3e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107825044 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.857; 覆盖度=87.5; E 值=1.91e-58 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |