基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029626 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:95712382-95715032 (-) |
| 描述 | Similar to PLIM2C: LIM domain-containing protein PLIM2c (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_029626 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g61230 |
与肌动蛋白丝结合并促进交联成粗束。 | |
At3g55770 |
与肌动蛋白丝结合并促进交联成粗束。 | |
At2g39900 |
与肌动蛋白丝结合并促进交联成粗束。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g45800 |
与肌动蛋白丝结合并促进交联成粗束。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0532500 |
含LIM结构域的蛋白质PLIM2b。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0051017 | actin filament bundle assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.286; 覆盖度=106.599; E 值=2.98e-77; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=58.378; 覆盖度=93.909; E 值=1.69e-75; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.286; 覆盖度=106.599; E 值=2.98e-77; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005856 | cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.286; 覆盖度=106.599; E 值=2.98e-77; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.286; 覆盖度=106.599; E 值=2.98e-77; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.694; 覆盖度=87.817; E 值=2.71e-76; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.286; 覆盖度=106.599; E 值=2.98e-77; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051015 | actin filament binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.286; 覆盖度=106.599; E 值=2.98e-77; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G39900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.92; 覆盖度=88.325; E 值=5.75e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G45800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=58.378; 覆盖度=93.909; E 值=1.69e-75 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G55770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.694; 覆盖度=87.817; E 值=2.71e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G61230 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.286; 覆盖度=106.599; E 值=2.98e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |