基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029058 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:79365780-79370883 (-) |
| 描述 | Similar to At1g65750: Putative ribonuclease H protein At1g65750 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029058 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 0 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g65750 |
推定的核糖核酸酶H蛋白At1g65750。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: P93295 |
未表征的线粒体蛋白 AtMg00310。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.653; 覆盖度=11.277; E 值=6.44e-06; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.111; 覆盖度=10.357; E 值=5.18e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015074 | DNA integration | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.111; 覆盖度=10.357; E 值=5.18e-10; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071897 | DNA biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.653; 覆盖度=11.277; E 值=6.44e-06; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=30.201; 覆盖度=17.146; E 值=4.16e-12; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042575 | DNA polymerase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.653; 覆盖度=11.277; E 值=6.44e-06; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003676 | nucleic acid binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.682; 覆盖度=50.633; E 值=3.45e-23; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003964 | RNA-directed DNA polymerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.111; 覆盖度=10.357; E 值=5.18e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004190 | aspartic-type endopeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.111; 覆盖度=10.357; E 值=5.18e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004519 | endonuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.111; 覆盖度=10.357; E 值=5.18e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004523 | RNA-DNA hybrid ribonuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.682; 覆盖度=50.633; E 值=3.45e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.653; 覆盖度=11.277; E 值=6.44e-06; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.111; 覆盖度=10.357; E 值=5.18e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.682; 覆盖度=50.633; E 值=3.45e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |