基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_027632 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:20691776-20695612 (-) |
| 描述 | Similar to rimM: Ribosome maturation factor RimM (Synechococcus sp. (strain RCC307) OX%3D316278) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_027632 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006364 | rRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.153; 覆盖度=29.531; E 值=5.01e-38; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042274 | ribosomal small subunit biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.153; 覆盖度=29.531; E 值=5.01e-38; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.153; 覆盖度=29.531; E 值=5.01e-38; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005840 | ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.153; 覆盖度=29.531; E 值=5.01e-38; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043022 | ribosome binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.153; 覆盖度=29.531; E 值=5.01e-38; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | npu:Npun_F1948 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.465; 覆盖度=33.594; E 值=6e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pmf:P9303_26021 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.5; 覆盖度=30.0; E 值=6.65e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pmt:PMT_1951 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.5; 覆盖度=30.0; E 值=6.72e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syr:SynRCC307_0135 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.153; 覆盖度=29.531; E 值=5.01e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syx:SynWH7803_0201 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.683; 覆盖度=29.531; E 值=6.31e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |