基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025298 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:109429551-109430691 (-) |
| 描述 | Similar to EXLA1: Expansin-like A1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025298 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g45970 |
类Expansin A1。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g45960 |
类膨胀蛋白 A3。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g38400 |
类膨胀素 A2。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0542400 |
类膨胀素 A2。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0132200 |
类Expansin A1。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009826 | unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107; UniProt GO evidence=NAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009828 | plant-type cell wall loosening | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0099503 | secretory vesicle | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G45960 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.078; 覆盖度=96.629; E 值=1.04e-104 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G45970 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.257; 覆盖度=96.255; E 值=3.04e-107 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G38400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=63.333; 覆盖度=89.888; E 值=4.08e-101 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0132200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.846; 覆盖度=92.509; E 值=8.97e-92 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0542400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.615; 覆盖度=97.378; E 值=2.85e-92 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |